這個故事圍繞著兩個神：宇宙和混亂。
除了眾神及其冠軍之外，玩家還處理了稱為Manikins的水晶般的多皮特舞者。
故事“ Final Dissidia for Fantasy ”圍繞著兩個神：宇宙，和諧女神和混亂，不和諧之神。
該遊戲具有一個總體的故事情節，需要遍歷所有角色才能完成。
該遊戲包含22個總可玩角色：十個英雄和十個惡棍，
每種代表決賽幻想中的幻想中的一個，
和兩個秘密角色：代表最終幻想XI的女主人公，
和代表決賽的反派芬達XII。最初，只有十個主要英雄在所有遊戲模式中都可以玩。
十個主要的惡棍在街機模式下可玩，但仍必須解鎖以在所有其他遊戲模式下訪問。
眾神的宇宙和混亂已經與“世界”陷入了永恆的衝突，
第一個幻想發生的“世界”領域的鏡子維度，
從主要係列中召集了來自其他世界的幾位戰士，以永無止境的死亡和重生循環為止，直到平衡得到混亂為止。
該遊戲將主角和對抗者團結起來，從主要的Final Dissidia for Fantasy系列的分期付款，
他們的故事是由第二場比賽的盧法因（Lufaine）介紹的。
隨著戰爭似乎即將結束，Cosmos樂隊的十個戰士一起擊退了Chaos的奴才並恢復了平衡。
在上一個週期中失去了大部分力量，Cosmos為她提供了十個光線，發射，洋蔥騎士，塞西爾，巴茨，Terra，Terra，Cloud，squall，squall，Zidane，
和tidus - 取回十個晶體的任務將有助於他們擊敗混亂。
他們每個人都出發了一個名為“命運奧德賽”的旅程，他們各自的故事都被講述並相互鏈接。
在他們的“命運奧德賽”期間，英雄遇到了他們的個人惡棍，
通過頓悟擊敗他們，以幫助他們獲得晶體。
遵循“命運奧德賽”是“陰影衝動”，所有十個戰士都擁有他們的水晶，
但是，為時已晚，無法拯救被混亂殺死的宇宙。
英雄開始消失，但被水晶的力量拯救了
允許他們利用他們剩下的時間來反擊小人，一勞永逸地擊敗混亂。
最後，其他戰士為自己的世界留下了世界，戰士燈開始了另一種冒險，
建立原始幻想的事件，Cosmos復興以統治世界。
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